给我们谜语：两个女孩——最好的朋友——在同一个小镇长大，上同一所学校，有着相似的饮食习惯、生活方式，甚至课外活动。
他们的两个妈妈都致力于给女儿喂食有机种植的完整、真实、健康的食物；确保他们有足够的时间在户外玩耍和晒太阳；并有固定的就寝时间，这样他们每个人都能得到充足的睡眠。
一个女孩非常健康——事实上，她非常健康，很少生病，从未服用过抗生素，也从未旷过一天的课。但另一个女孩却饱受健康问题的困扰，包括高烧和顽固的皮疹，一次困扰她数月之久。她似乎把所有的虫子都带到了家里，而且她经常因为病得太重而不能去上学而缺课。
这是西海岸的一个嬉皮士小镇，两个孩子都没有接种疫苗。所以，毫不奇怪，两个女孩最终都得了水痘。经常生病的女孩高烧卧床，大痘渗水起泡，精神萎靡。她的腺体肿胀，几乎没有力气坐在床上。而很少生病的女孩，却没有发烧，只是长了一点点痘痘。事实上，她精力充沛，以至于她央求父亲带她去滑板公园。
这是一个真实的故事。一个长期困扰我们的问题。
鉴于他们的相似之处，为什么一个朋友总是生病而另一个朋友却那么健康？
很容易说这是“在他们的基因中”或归咎于压力（生病的孩子的父母在她很小的时候就离婚了，并且继续保持对立关系，越来越多的研究表明压力会抑制免疫系统并且实际上可以让你生病）。
但现在发表在《细胞》杂志上的一项经过同行评审的新研究提出了另一种解释：生病的孩子母亲的微生物群可能部分归咎于她女儿持续的健康问题。
母亲肠道中的微生物将基因转移给婴儿
正如这项新研究中详述的那样，研究人员发现母亲肠道中的微生物可以将基因直接转移到婴儿的肠道微生物中。他们这样做并没有将整个微生物菌株从母亲转移到孩子身上。
这项工作是由麻省理工学院布罗德研究所和哈佛大学的一个团队完成的。
Broad Institute 是位于马萨诸塞州剑桥市的一家非营利性研究中心，专注于基因组医学。
这项工作发表在《细胞》杂志上，详细分析了 70 位母亲及其婴儿的肠道细菌基因组。它显示了遗传元素从母亲的微生物组到婴儿的大规模流动的证据。
微生物影响免疫力
虽然我们大多数人不会花太多时间思考我们身体的非人类同居者，但我们实际上有许多种类的细菌，以及生活在我们身上和体内的真菌、原生生物和病毒。总而言之，这些微生物被称为“微生物组”。
我们身体的微观同居者并没有从我们身上搭便车。相反，它们在我们健康和福祉的许多方面帮助我们，包括消化、循环、心理健康和我们对抗疾病的能力。
事实证明，婴儿体内微生物群的微生物构成极大地影响了其免疫系统，这就是为什么一些专家将人体微生物群称为身体的“其他免疫系统”。
微生物组在生命的第一年可能尤为重要，而婴儿的获得性免疫系统仍在上线。但婴儿的微生物组也会影响其他各种系统的发育，包括婴儿的新陈代谢甚至认知发育。
阴道出生的婴儿直接从母亲那里获取重要的有益微生物，因为他们顺着产道进入产道并接触到母亲的阴道菌群（以及肛门菌群）。微生物组从母亲直接转移到婴儿是研究人员多年来已经了解的事情。
由于通过剖腹产出生的婴儿无法充分接种母亲的微生物，因此微生物群失调是尽可能避免剖腹产的主要原因之一。
水平基因转移
然而，在这项新研究中，科学家们发现婴儿的微生物从母亲的微生物组中获取了属于自身未被传递的微生物的基因。
不知何故，这些细菌基因在没有它们所属的生物体的情况下进行了交换。
这种交换被称为“水平基因转移”，其中基因被传递到生物体之外，而生物体的 DNA 是它们的一部分。
细菌一直在进行水平基因转移，这种现象在生物学领域的科学文献中有详细记载。
但是直到现在，细菌基因可以从母亲传给孩子的想法在医学界几乎不为人知。
在病毒
的帮助下 研究人员发现了基因转移涉及噬菌体的证据。噬菌体是捕食细菌的病毒，将它们的基因组插入细菌的基因组中。
当这些病毒控制细菌 DNA 时，它们可以从细菌中释放一些细菌基因，并促进基因转移到其他细胞，在这种情况下，从母亲的微生物组转移到婴儿的。
当基因从母亲的肠道转移到婴儿的肠道时，它会影响婴儿微生物组的新陈代谢。这反过来会影响婴儿自身的新陈代谢。
如果纯母乳喂养，婴儿的微生物组和新陈代谢会非常不同。母乳喂养以有益的方式改变了婴儿的微生物组。研究人员发现，母乳喂养的婴儿有数百种不同的代谢标记物，这些标记物已被母乳中的微生物组代谢，可能会影响他们的免疫系统、新陈代谢和认知发育。
回到我们现实世界的难题，其中 N（任何给定实验的参与者人数）仅等于二。一直生病的女孩的妈妈告诉我们，她认为女儿的挣扎是因为她自己小时候病得很重，而且她在十几岁的时候为了对抗粉刺而服用抗生素多年，扰乱了自己的微生物群。更重要的是，抗生素并没有改善她的皮肤，她说，她后悔服用了它们。
从这门新科学中得出的结论可能是，我们都需要更多地关注非人类身体伴侣的照顾和喂养。虽然我们不能回头改变我们童年时期的健康习惯，但我们可以从现在开始在我们的生活中养成有益于微生物组的健康习惯。
吃真正的食物是“益生元”，因为它会促进体内健康细菌和其他微生物的繁殖。避免使用对有益细菌造成损害的抗生素、杀虫剂和除草剂（尤其是草甘膦）也很重要。
你也可以吃益生菌食物。这些食物含有被认为有益健康的活细菌。益生菌食品包括发酵酸菜、泡菜和其他蔬菜、全脂无糖酸奶和开菲尔。
阴道播种——将阴道菌群从妈妈转移到新生儿的嘴巴、鼻子和皮肤——对于通过剖腹产和纯母乳喂养出生的婴儿，也将有助于为婴儿培养健康的微生物群。
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